今日は問題ではなく解説です。 ●リボース・デオキシリボース・ジデオキシリボース 遺伝子に含まれる糖の種類をまとめます。バックナンバー212でも一度やっていますので、よかったら見てみてください。 ・リボース(C5H10 O5)RNAの構成糖 C:H:O=1:2:1の基本形に従い、もっともシンプルな名称 ・デオキシリボース(C5H10 O4)DNAの構成糖 リボースから1つ酸素原子をとった(deー取るの意味、oxyー酸素ー)もの ・ジデオキシリボース(C5H10 O3) 普通生物には存在しない。DNA塩基配列決定のために意図的に加える。 リボースから2つOをとったもの(di-2つ、de−取る、oxyー酸素) さて「ジデオキシリボース」は実は、次のヌクレオチドが結合するはずの3´炭素についたOHのOが取れてしまっているため、DNAの伸長反応がおきなくなってしまう。 さて、 未知のDNAの塩基配列を決定するために、その塩基配列に相補的な鎖の伸長反応を起こさせるため、実験系は4系列行う。 @DNAの素材である普通のdATP(デオキシアデノシン三リン酸)、dTTP、 dGTP,dCTPの他に、意図的にddATP(ジデオキシアデノシン三リン酸) を加える実験系 AdATP、dTTP,dGTP,dCTPの他に意図的にddTTPを加える実験系 BdATP,dTTP,dGTP,dCTPの他に意図的にddGTPを加える実験系 CdATP,dTTP,dGTP,dCTPの他に意図的にddCTPを加える実験系 この中で@(意図的にddATPを追加した実験系)を代表例として図に示してある。 伸長反応が起きるが、調べたい鎖のある位置にTがあった場合、それに相補的な位置にAを持ったdATPが入る。その場合は、その後も伸長反応が続く。 しかしその位置にddATPが入り込んだ場合、伸長反応はそこで停止し、 「その位置で伸長を止めた」短い鎖となる。 Tの位置に相補的な長さを持った短い断片がいくつかでき、それを調べるともとの不明なDNAでTのあった位置がわかる。 (続きはあした) |